После подключения первого джойстика, залезть в системные настройки, соединить второй джойстик и нажать поиск устройств (кнопка PS). И держать ее пока не появится настройки на экране. Все. Можно использовать.
Банально, может быть сам джойстик неисправен. Это первое, что приходит на ум. А так, обновите драйвера, включите и выключите, вариантов много,на самом деле.